號誌系統設置於正線與基地,以確保行車之安全,主要包含了下列各子系統及設備:列車自動控制系統(Automatic Train Control System)、電子聯鎖系統(Electronic Interlocking System)、軌道防護系統(Track Protection System)、電源供應系統(Power Supply System)、災害警告系統(Disaster Warning System)、號誌道旁設備(Signaling Wayside Equipment)、遙測系統(Telemetry System)及行車控制系統(Traffic Control System)。